Pour cette 13ème étape, les coureurs se sont donnés rendez-vous au sommet de la Sierra Nevada. Et c'est un groupe de baroudeurs mais également de grimpeurs qui s'est extirpé du peloton. Composé de David Moncoutié, le leader du classement de la montagne, David Garcia-Dapena (Xacobeo-Galicia), Johnny Hoogerland (Vacansoleil), Adrian Palomares (Contentpolis-Ampo), Joaquin Rodriguez (Caisse d'Epargne), Rein Taaramae (Cofidis), Amets Txurruka (Euskaltel-Euskadi), Koos Moerenhout et Pieter Weening (Rabobank). Le Français s'est détaché dans la descente du Puerto de la Ragua à 105 kilomètres du but pour ne plus jamais être repris. Il s'est imposé en solitaire devançant d'une minute les favoris qui seront restés groupés à l'exception de Cadel Evans, victime d'ennuis techniques.

Classement 13ème étape :

1. David Moncoutié (FRA, Cofidis) en 5h09'22"
2. Ezequiel Mosquera (ESP, Xacobeo-Galicia) à 52 sec.
3. Alejandro Valverde (ESP, Caisse d'Epargne) à 1'16"
4. Robert Gesink (PBS, Rabobank) m.t.
5. Ivan Basso (ITA, Liquigas) m.t.
6. Samuel Sanchez (ESP, Euskaltel-Euskadi) à 1'37"
7. Joaquim Rodriguez (ESP, Caisse d'Epargne) à 2'09"
8. Cadel Evans (AUS, Silence-Lotto) à 2'24"
9. Paolo Tiralongo (ITA, Lampre-NGC) à 2'31"
10. Amaël Moinard (FRA, Cofidis) à 3'37"

Classement général :

1. Alejandro Valverde (ESP, Caisse d'Epargne) en 56h23'08"
2. Robert Gesink (PBS, Rabobank) à 27 sec.
3. Ivan Basso (ITA, Liquigas) à 1'02"
4. Cadel Evans (AUS, Silence-Lotto) à 1'23"
5. Samuel Sanchez (ESP, Euskaltel-Euskadi) à 1'32"
6. Ezequiel Mosquera (ESP, Xacobeo-Galicia) à 1'46"
7. Joaquim Rodriguez (ESP, Caisse d'Epargne) à 5'02"
8. Paolo Tiralongo (ITA, Lampre-NGC) à 5'33"
9. Daniel Navarro (ESP, Astana) à 8'21"
10. Johnny Hoogerland (PBS, Vacansoleil) à 10'23"